Table 1 Distribution of the clinicopathological characteristics of all samples or Her2-amplified samples split into discovery and validation cohorts according to the Morisita index

Number

316

170

377

139

42

34

37

20

Follow up (months)

117.7 (4.9–120)

110.3 (4.2–120)

64.8 (0.3–120)

50.5 (1.9–120)

108.1 (21.2–120)

61.5 (6.8–120)

62.3 (1.8–120)

36.3 (10–88.4)

Age, years

59.8 (27.6–86.1)

59.3 (21.9–83.4)

0.38

60.8 (30–92.1)

60.9 (26.4–96.3)

0.81

57 (28.4–80.6)

54.2 (21.9–71)

0.23

57.4 (33.6–87)

55.9 (35.9–87.2)

0.65

Death

No

246 (77.8 %)

113 (66.5 %)

0.0074*

334 (88.6 %)

115 (82.7 %)

0.1

25 (59.5 %)

14 (41.2 %)

0.097

35 (94.6 %)

13 (65 %)

0.0063*

Yes

64 (20.3 %)

53 (31.2 %)

43 (11.4 %)

24 (17.3 %)

14 (33.3 %)

19 (55.9 %)

2 (5.4 %)

7 (35 %)

Size

<2 cm

122 (38.6 %)

66 (38.8 %)

0.88

120 (31.8 %)

41 (29.5 %)

0.27

9 (21.4 %)

13 (38.2 %)

0.15

9 (24.3 %)

9 (45 %)

0.056

>2 cm, <5 cm

177 (56 %)

97 (57.1 %)

226 (59.9 %)

80 (57.6 %)

30 (71.4 %)

17 (50 %)

24 (64.9 %)

7 (35 %)

>5 cm

17 (5.4 %)

7 (4.1 %)

29 (7.7 %)

17 (12.2 %)

3 (7.1 %)

4 (11.8 %)

3 (8.1 %)

4 (20 %)

Node

Neg (pN0)

153 (48.4 %)

84 (49.4 %)

0.85

180 (47.7 %)

57 (41 %)

0.19

19 (45.2 %)

10 (29.4 %)

0.23

15 (40.5 %)

9 (45 %)

0.78

Pos (pN1-pN3)

163 (51.6 %)

86 (50.6 %)

193 (51.2 %)

80 (57.6 %)

23 (54.8 %)

24 (70.6 %)

22 (59.5 %)

11 (55 %)

Grade

1

37 (11.7 %)

18 (10.6 %)

0.39

42 (11.1 %)

9 (6.5 %)

0.069

1 (2.4 %)

0 (0 %)

1

2 (5.4 %)

0 (0 %)

0.86

2

120 (38 %)

56 (32.9 %)

123 (32.6 %)

59 (42.4 %)

8 (19 %)

7 (20.6 %)

6 (16.2 %)

3 (15 %)

3

149 (47.2 %)

92 (54.1 %)

192 (50.9 %)

64 (46 %)

32 (76.2 %)

27 (79.4 %)

26 (70.3 %)

15 (75 %)

ER

Neg

76 (24.1 %)

54 (31.8 %)

0.069

82 (21.8 %)

39 (28.1 %)

0.16

22 (52.4 %)

19 (55.9 %)

0.82

14 (37.8 %)

14 (70 %)

0.028*

Pos

240 (75.9 %)

116 (68.2 %)

295 (78.2 %)

100 (71.9 %)

20 (47.6 %)

15 (44.1 %)

23 (62.2 %)

6 (30 %)

Her2

Not amplified

271 (85.8 %)

139 (81.8 %)

0.29

335 (88.9 %)

123 (88.5 %)

0.87

42 (100 %)

34 (100 %)

NA

37 (100 %)

20 (100 %)

NA

Amplified

45 (14.2 %)

31 (18.2 %)

41 (10.9 %)

16 (11.5 %)

20 (47.6 %)

14 (41.2 %)

24 (64.9 %)

6 (30 %)

TP53

WT

224 (70.9 %)

110 (64.7 %)

0.076

252 (66.8 %)

94 (67.6 %)

1

20 (47.6 %)

20 (58.8 %)

0.49

7 (18.9 %)

10 (50 %)

0.011*

Mutated

83 (26.3 %)

59 (34.7 %)

94 (24.9 %)

35 (25.2 %)

9 (21.4 %)

28 (82.4 %)

7 (18.9 %)

14 (70 %)

IA

Low

89 (28.2 %)

148 (87.1 %)

1.1×10⁻³⁷*

71 (18.8 %)

111 (79.9 %)

1.5×10⁻³⁷*

33 (78.6 %)

6 (17.6 %)

1.6×10⁻⁷*

30 (81.1 %)

6 (30 %)

0.00036*

High

227 (71.8 %)

22 (12.9 %)

306 (81.2 %)

28 (20.1 %)

4 (9.5 %)

4 (11.8 %)

5 (13.5 %)

2 (10 %)

Pam50

Basal

54 (17.1 %)

43 (25.3 %)

0.15

57 (15.1 %)

21 (15.1 %)

0.45

25 (59.5 %)

16 (47.1 %)

0.83

13 (35.1 %)

9 (45 %)

0.46

HER2

50 (15.8 %)

18 (10.6 %)

30 (8 %)

12 (8.6 %)

5 (11.9 %)

4 (11.8 %)

7 (18.9 %)

1 (5 %)

LumA

106 (33.5 %)

49 (28.8 %)

129 (34.2 %)

50 (36 %)

6 (14.3 %)

7 (20.6 %)

9 (24.3 %)

4 (20 %)

LumB

86 (27.2 %)

48 (28.2 %)

103 (27.3 %)

28 (20.1 %)

2 (4.8 %)

3 (8.8 %)

3 (8.1 %)

4 (20 %)

Normal

19 (6 %)

11 (6.5 %)

58 (15.4 %)

28 (20.1 %)

42

34

37

20