From: Polarity gene alterations in pure invasive micropapillary carcinomas of the breast
SNP start | SNP end | Chr | Cytoband | IMPCs (%) | IDC-NSTs (%) | Genes of interest |
---|---|---|---|---|---|---|
Common regions | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
 Gains |  |  |  |  |  |  |
  36948617 | 146292734 | 8 | p11.23-q24.3 | 60 | 45 |  |
 Losses |  |  |  |  |  |  |
  113565 | 35436036 | 8 | p23.3-p12 | 63 | 63 |  |
  46534977 | 90163275 | 16 | q11.2-q24.3 | 55b | 54 |  |
  6689 | 18896297 | 17 | p13.3-p11.2 | 46 | 43b |  |
  16055171 | 51219006 | 22 | q11.1-q13.33 | 52 | 40 |  |
Specific regions | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
 Gains |  |  |  |  |  |  |
  197811282 | 249198692 | 1 | q31.3-q44 | 23 | 48 |  |
  52579874 | 67308196 | 17 | q22-q24.3 | 47 | 25 |  |
  33435161 | 62648208 | 20 | q13.12-q13.33 | 17 | 44 |  |
 Losses |  |  |  |  |  |  |
  101380020 | 125365648 | 6 | q16.3-q22.31 | 45b | 20 |  |
  705598 | 13611533 | 18 | p11.32-p11.21 | 15 | 42 |  |
  28175177 | 35313501 | 18 | q12.1-q12.2 | 24 | 40 |  |
 Amplifications |  |  |  |  |  |  |
  37097563 | 38618768 | 8 | p11.23-p11.22 | 13 | 26 | FGFR1, PPAPDC1B, WHSC1L1 |
  94967717 | 97023919 | 8 | q22.1 | 21 | 5 | RAD54B, CCNE2, TP53INP1 |
  115849871 | 138121678 | 8 | q23.3-q24.23 | 21 | 14 | MYC |
  69073647 | 70229171 | 11 | q13.3-q25 | 7 | 22 | CCND1, ORAOV1, FGF19, FGF4, FGF3 |
  37298761 | 38225021 | 17 | q12-q21.1 | 22 | 24 | STARD3, ERBB2, GRB7 |
  57159990 | 62354992 | 17 | q22-q23.3 | 22 | 7 | BCAS3, TBX2, TLK2, TANC2, PPM1D |
  50695849 | 52586281 | 20 | q13.2 | 15 | 26 | ZNF217, BCAS1 |