|  |  |  |  | MCBCS | SASBAC |  | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Chr | Gene Name | Effect | SNP | Position (bp) | N | PMD Est (SE)/ adj meanc | P-valued | N | Sqrt PMD Est (SE)/ adj meane | P-valued | P-Hetf |
1 | GALNT2 | Ordinal | rs1043908 | 228483917 | 484 | 2.88 (1.28) | 0.025 | 725 | -0.314 (0.135) | 0.02 | < 0.001 |
 |  | A/A |  |  | 373 | 17.9 |  | 555 | 19.0 |  |  |
 |  | A/G |  |  | 102 | 20.8 |  | 158 | 16.3 |  |  |
 |  | G/G |  |  | 9 | 23.6 |  | 12 | 13.9 |  |  |
2 | LOC375190 | Ordinal | rs2080727 | 24204411 | 484 | 1.69 (0.85) | 0.048 | 725 | 0.185 (0.095) | 0.05 | 0.54 |
 |  | A/A |  |  | 195 | 17.2 |  | 305 | 17.1 |  |  |
 |  | A/G |  |  | 215 | 19.4 |  | 332 | 18.7 |  |  |
 |  | G/G |  |  | 74 | 20.2 |  | 88 | 20.3 |  |  |
6 | MCM3 | Ordinal | rs3765447 | 52249471 | 483 | 3.62 (1.76) | 0.040 | 725 | 0.45 (0.188) | 0.017 | 0.96 |
 |  | A/A |  |  | 422 | 18.2 |  | 644 | 17.7 |  |  |
 |  | A/G |  |  | 60 | 22.3 |  | 76 | 21.7 |  |  |
 |  | G/G |  |  | 1 | 12.7 |  | 5 | 26.1 |  |  |
8 | TNKS | Ordinal | rs12549064 | 9479437 | 484 | -2.15 (1.09) | 0.048 | 725 | 0.321 (0.116) | 0.006 | 0.001 |
 |  | A/A |  |  | 303 | 19.5 |  | 496 | 17.8 |  |  |
 |  | A/C |  |  | 166 | 17.4 |  | 205 | 20.6 |  |  |
 |  | C/C |  |  | 15 | 15.1 |  | 24 | 23.6 |  |  |
10 | KIF11 | Ordinal | rs2275220 | 94362686 | 484 | -4.23 (2.12) | 0.046 | 726 | 0.45 (0.172) | 0.009 | 0.005 |
 |  | A/A |  |  | 448 | 19.0 |  | 613 | 17.9 |  |  |
 |  | A/G |  |  | 34 | 13.5 |  | 111 | 22.0 |  |  |
 |  | G/G |  |  | 2 | 20.4 |  | 2 | 26.4 |  |  |
11 | STIM1 | Ordinal | rs3794050 | 4068476 | 484 | 2.85 (1.38) | 0.039 | 726 | -0.383 (0.142) | 0.007 | 0.003 |
 |  | G/G |  |  | 389 | 17.8 |  | 547 | 19.4 |  |  |
 |  | G/A |  |  | 89 | 23.0 |  | 173 | 16.2 |  |  |
 |  | A/A |  |  | 6 | 8.6 |  | 6 | 13.3 |  |  |
17 | AURKB | Ordinal | rs3027260 | 8053911 | 484 | -3.33 (1.52) | 0.029 | 726 | -0.404 (0.177) | 0.022 | 0.73 |
 |  | G/G |  |  | 404 | 19.2 |  | 632 | 18.7 |  |  |
 |  | G/A |  |  | 77 | 15.8 |  | 91 | 15.4 |  |  |
 |  | A/A |  |  | 3 | 12.8 |  | 3 | 12.4 |  |  |
 |  | Ordinal | rs4792590 | 8057840 | 484 | -3.14 (1.34) | 0.020 | 726 | -0.39 (0.152) | 0.010 | 0.89 |
 |  | G/G |  |  | 377 | 19.3 |  | 597 | 18.6 |  |  |
 |  | G/A |  |  | 102 | 16.6 |  | 121 | 15.4 |  |  |
 |  | A/A |  |  | 5 | 9.5 |  | 8 | 12.5 |  |  |