TY - JOUR AU - Polyak, K. PY - 2007 DA - 2007// TI - Breast cancer: origins and evolution JO - J Clin Invest VL - 117 UR - https://doi.org/10.1172/JCI33295 DO - 10.1172/JCI33295 ID - Polyak2007 ER - TY - JOUR AU - Van Belle, V. AU - Van Calster, B. AU - Brouckaert, O. AU - Vanden Bempt, I. AU - Pintens, S. AU - Harvey, V. AU - Murray, P. AU - Naume, B. AU - Wiedswang, G. AU - Paridaens, R. AU - Moerman, P. AU - Amant, F. AU - Leunen, K. AU - Smeets, A. AU - Drijkoningen, M. AU - Wildiers, H. AU - Christiaens, M. R. AU - Vergote, I. AU - Van Huffel, S. AU - Neven, P. PY - 2010 DA - 2010// TI - Qualitative assessment of the progesterone receptor and HER2 improves the Nottingham Prognostic Index up to 5 years after breast cancer diagnosis JO - J Clin Oncol VL - 28 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2009.26.4200 DO - 10.1200/JCO.2009.26.4200 ID - Van Belle2010 ER - TY - JOUR AU - Cleator, S. AU - Heller, W. AU - Coombes, R. C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Triple-negative breast cancer: therapeutic options JO - Lancet Oncol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1016/S1470-2045(07)70074-8 DO - 10.1016/S1470-2045(07)70074-8 ID - Cleator2007 ER - TY - JOUR AU - Gusterson, B. PY - 2009 DA - 2009// TI - Do 'basal-like' breast cancers really exist? JO - Nat Rev Cancer VL - 9 UR - https://doi.org/10.1038/nrc2571 DO - 10.1038/nrc2571 ID - Gusterson2009 ER - TY - JOUR AU - Rakha, E. A. AU - Reis-Filho, J. S. AU - Ellis, I. O. PY - 2008 DA - 2008// TI - Basal-like breast cancer: a critical review JO - J Clin Oncol VL - 26 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2007.13.1748 DO - 10.1200/JCO.2007.13.1748 ID - Rakha2008 ER - TY - JOUR AU - Sørlie, T. AU - Perou, C. M. AU - Tibshirani, R. AU - Aas, T. AU - Geisler, S. AU - Johnsen, H. AU - Hastie, T. AU - Eisen, M. B. AU - van de Rijn, M. AU - Jeffrey, S. S. AU - Thorsen, T. AU - Quist, H. AU - Matese, J. C. AU - Brown, P. O. AU - Botstein, D. AU - Eystein Lønning, P. AU - Børresen-Dale, A. L. PY - 2001 DA - 2001// TI - Gene expression patterns of breast carcinomas distinguish tumor subclasses with clinical implications JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 98 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.191367098 DO - 10.1073/pnas.191367098 ID - Sørlie2001 ER - TY - JOUR AU - Sørlie, T. AU - Tibshirani, R. AU - Parker, J. AU - Hastie, T. AU - Marron, J. S. AU - Nobel, A. AU - Deng, S. AU - Johnsen, H. AU - Pesich, R. AU - Geisler, S. AU - Demeter, J. AU - Perou, C. M. AU - Lønning, P. E. AU - Brown, P. O. AU - Børresen-Dale, A. L. AU - Botstein, D. PY - 2003 DA - 2003// TI - Repeated observation of breast tumor subtypes in independent gene expression data sets JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 100 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0932692100 DO - 10.1073/pnas.0932692100 ID - Sørlie2003 ER - TY - JOUR AU - Foulkes, W. D. AU - Smith, I. E. AU - Reis-Filho, J. S. PY - 2010 DA - 2010// TI - Triple-negative breast cancer JO - N Engl J Med VL - 363 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMra1001389 DO - 10.1056/NEJMra1001389 ID - Foulkes2010 ER - TY - JOUR AU - Esteva, F. J. AU - Yu, D. AU - Hung, M. C. AU - Hortobagyi, G. N. PY - 2010 DA - 2010// TI - Molecular predictors of response to trastuzumab and lapatinib in breast cancer JO - Nat Rev Clin Oncol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/nrclinonc.2009.216 DO - 10.1038/nrclinonc.2009.216 ID - Esteva2010 ER - TY - JOUR AU - Carey, L. A. AU - Dees, E. C. AU - Sawyer, L. AU - Gatti, L. AU - Moore, D. T. AU - Collichio, F. AU - Ollila, D. W. AU - Sartor, C. I. AU - Graham, M. L. AU - Perou, C. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - The triple negative paradox: primary tumor chemosensitivity of breast cancer subtypes JO - Clin Cancer Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-06-1109 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-06-1109 ID - Carey2007 ER - TY - JOUR AU - Rouzier, R. AU - Perou, C. M. AU - Symmans, W. F. AU - Ibrahim, N. AU - Cristofanilli, M. AU - Anderson, K. AU - Hess, K. R. AU - Stec, J. AU - Ayers, M. AU - Wagner, P. AU - Morandi, P. AU - Fan, C. AU - Rabiul, I. AU - Ross, J. S. AU - Hortobagyi, G. N. AU - Pusztai, L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Breast cancer molecular subtypes respond differently to preoperative chemotherapy JO - Clin Cancer Res VL - 11 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-04-2421 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-04-2421 ID - Rouzier2005 ER - TY - JOUR AU - von Minckwitz, G. AU - Untch, M. AU - Nüesch, E. AU - Loibl, S. AU - Kaufmann, M. AU - Kümmel, S. AU - Fasching, P. A. AU - Eiermann, W. AU - Blohmer, J. U. AU - Costa, S. D. AU - Mehta, K. AU - Hilfrich, J. AU - Jackisch, C. AU - Gerber, B. AU - du Bois, A. AU - Huober, J. AU - Hanusch, C. AU - Konecny, G. AU - Fett, W. AU - Stickeler, E. AU - Harbeck, N. AU - Müller, V. AU - Jüni, P. PY - 2011 DA - 2011// TI - Impact of treatment characteristics on response of different breast cancer phenotypes: pooled analysis of the German neo-adjuvant chemotherapy trials JO - Breast Cancer Res Treat VL - 125 UR - https://doi.org/10.1007/s10549-010-1228-x DO - 10.1007/s10549-010-1228-x ID - von Minckwitz2011 ER - TY - JOUR AU - Kaufman, P. A. AU - Broadwater, G. AU - Lezon-Geyda, K. AU - Dressler, L. G. AU - Berry, D. AU - Friedman, P. AU - Winer, E. P. AU - Hudis, C. AU - Ellis, M. J. AU - Seidman, A. D. AU - Harris, L. N. PY - 2007 DA - 2007// TI - CALGB 150002: Correlation of HER2 and chromosome 17 (ch17) copy number with trastuzumab (T) efficacy in CALGB 9840, paclitaxel (P) with or without T in HER2+ and HER2- metastatic breast cancer (MBC) [abstract] JO - J Clin Oncol VL - 25 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2006.10.4638 DO - 10.1200/JCO.2006.10.4638 ID - Kaufman2007 ER - TY - JOUR AU - Paik, S. AU - Kim, C. AU - Jeong, J. AU - Geyer, C. E. AU - Romond, E. H. AU - Mejia-Mejia, O. AU - Mamounas, E. P. AU - Wickerham, D. AU - Costantino, J. P. AU - Wolmark, N. PY - 2007 DA - 2007// TI - Benefit from adjuvant trastuzumab may not be confined to patients with IHC 3+ and/or FISH-positive tumors: Central testing results from NSABP B-31 [abstract] JO - J Clin Oncol VL - 25 ID - Paik2007 ER - TY - JOUR AU - Paik, S. AU - Kim, C. AU - Wolmark, N. PY - 2008 DA - 2008// TI - HER2 status and benefit from adjuvant trastuzumab in breast cancer JO - N Engl J Med VL - 358 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMc0801440 DO - 10.1056/NEJMc0801440 ID - Paik2008 ER - TY - JOUR AU - Russnes, H. G. AU - Vollan, H. K. AU - Lingjaerde, O. C. AU - Krasnitz, A. AU - Lundin, P. AU - Naume, B. AU - Sørlie, T. AU - Borgen, E. AU - Rye, I. H. AU - Langerød, A. AU - Chin, S. F. AU - Teschendorff, A. E. AU - Stephens, P. J. AU - Månér, S. AU - Schlichting, E. AU - Baumbusch, L. O. AU - Kåresen, R. AU - Stratton, M. P. AU - Wigler, M. AU - Caldas, C. AU - Zetterberg, A. AU - Hicks, J. AU - Børresen-Dale, A. L. PY - 2010 DA - 2010// TI - Genomic architecture characterizes tumor progression paths and fate in breast cancer patients JO - Sci Transl Med VL - 2 UR - https://doi.org/10.1126/scitranslmed.3000611 DO - 10.1126/scitranslmed.3000611 ID - Russnes2010 ER - TY - JOUR AU - Perou, C. M. AU - Sørlie, T. AU - Eisen, M. B. AU - van de Rijn, M. AU - Jeffrey, S. S. AU - Rees, C. A. AU - Pollack, J. R. AU - Ross, D. T. AU - Johnsen, H. AU - Akslen, L. A. AU - Fluge, O. AU - Pergamenschikov, A. AU - Williams, C. AU - Zhu, S. X. AU - Lønning, P. E. AU - Børresen-Dale, A. L. AU - Brown, P. O. AU - Botstein, D. PY - 2000 DA - 2000// TI - Molecular portraits of human breast tumours JO - Nature VL - 406 UR - https://doi.org/10.1038/35021093 DO - 10.1038/35021093 ID - Perou2000 ER - TY - JOUR AU - Gatza, M. L. AU - Lucas, J. E. AU - Barry, W. T. AU - Kim, J. W. AU - Wang, Q. AU - Crawford, M. D. AU - Datto, M. B. AU - Kelley, M. AU - Mathey-Prevot, B. AU - Potti, A. AU - Nevins, J. R. PY - 2010 DA - 2010// TI - A pathway-based classification of human breast cancer JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 107 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0912708107 DO - 10.1073/pnas.0912708107 ID - Gatza2010 ER - TY - JOUR AU - Kim, C. AU - Paik, S. PY - 2010 DA - 2010// TI - Gene-expression-based prognostic assays for breast cancer JO - Nat Rev Clin Oncol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/nrclinonc.2010.61 DO - 10.1038/nrclinonc.2010.61 ID - Kim2010 ER - TY - JOUR AU - Sotiriou, C. AU - Pusztai, L. PY - 2009 DA - 2009// TI - Gene-expression signatures in breast cancer JO - N Engl J Med VL - 360 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMra0801289 DO - 10.1056/NEJMra0801289 ID - Sotiriou2009 ER - TY - JOUR AU - Shi, L. AU - Reid, L. H. AU - Jones, W. D. AU - Shippy, R. AU - Warrington, J. A. AU - Baker, S. C. AU - Collins, P. J. AU - de Longueville, F. AU - Kawasaki, E. S. AU - Lee, K. Y. AU - Luo, Y. AU - Sun, Y. A. AU - Willey, J. C. AU - Setterquist, R. A. AU - Fischer, G. M. AU - Tong, W. AU - Dragan, Y. P. AU - Dix, D. J. AU - Frueh, F. W. AU - Goodsaid, F. M. AU - Herman, D. AU - Jensen, R. V. AU - Johnson, C. D. AU - Lobenhofer, E. K. AU - Puri, R. K. AU - Scherf, U. AU - Thierry-Mieg, J. AU - Wang, C. AU - Wilson, M. AU - Wolber, P. K. AU - Zhang, L. AU - Amur, S. AU - Bao, W. AU - Barbacioru, C. C. AU - Bergstrom Lucas, A. AU - Bertholet, V. AU - Boysen, C. AU - Bromley, B. AU - Brown, D. AU - Brunner, A. AU - Canales, R. AU - Cao, X. M. AU - Cebula, T. A. AU - Chen, J. J. AU - Cheng, J. AU - Chu, T. M. AU - Chudin, E. AU - Corson, J. AU - Corton, J. C. AU - Croner, L. J. AU - Davies, C. AU - Davison, T. S. AU - Delenstarr, G. AU - Deng, X. AU - Dorris, D. AU - Eklund, A. C. AU - Fan, X. AU - Fang, H. AU - Fulmer-Smentek, S. AU - Fuscoe, J. C. AU - Gallagher, K. AU - Ge, W. AU - Guo, L. AU - Guo, X. AU - Hager, J. AU - Haje, P. K. AU - Han, J. AU - Han, T. AU - Harbottle, H. C. AU - Harris, S. C. AU - Hatchwell, E. AU - Hauser, C. A. AU - Hester, S. AU - Hong, H. AU - Hurban, P. AU - Jackson, S. A. AU - Ji, H. AU - Knight, C. R. AU - Kuo, W. P. AU - LeClerc, J. E. AU - Levy, S. AU - Li, Q. Z. AU - Liu, C. AU - Liu, Y. AU - Lombardi, M. J. AU - Ma, Y. AU - Magnuson, S. R. AU - Maqsodi, B. AU - McDaniel, T. AU - Mei, N. AU - Myklebost, O. AU - Baitang, N. AU - Novoradovskaya, N. AU - Orr, M. S. AU - Osborn, T. W. AU - Papallo, A. AU - Patterson, T. A. AU - Perkins, R. G. AU - Peters, E. H. AU - Peterson, R. AU - Philips, K. L. AU - Pine, S. P. AU - Pusztai, L. AU - Qian, F. AU - Ren, H. AU - Rosen, M. AU - Rosenzweig, B. A. AU - Samaha, R. R. AU - Schena, M. AU - Schroth, G. P. AU - Shchegrova, S. AU - Smith, D. D. AU - Staedtler, F. AU - Su, Z. AU - Sun, H. AU - Szallasi, Z. AU - Tezak, Z. AU - Thierry-Mieg, D. AU - Thompson, K. L. AU - Tikhonova, I. AU - Turpaz, Y. AU - Vallanat, B. AU - Van, C. AU - Walker, S. J. AU - Wang, S. J. AU - Wang, Y. AU - Wolfinger, R. AU - Wu, J. AU - Xiao, C. AU - Xie, Q. AU - Xu, J. AU - Yang, W. AU - Zhang, L. AU - Zhong, S. AU - Zong, Y. AU - Slikker, W. PY - 2006 DA - 2006// TI - The MicroArray Quality Control (MAQC) project shows inter- and intraplatform reproducibility of gene expression measurements JO - Nat Biotechnol VL - 24 UR - https://doi.org/10.1038/nbt1239 DO - 10.1038/nbt1239 ID - Shi2006 ER - TY - STD TI - Gene Expression Omnibus (GEO). [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/] UR - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ ID - ref22 ER - TY - JOUR AU - Parker, J. S. AU - Mullins, M. AU - Cheang, M. C. AU - Leung, S. AU - Voduc, D. AU - Vickery, T. AU - Davies, S. AU - Fauron, C. AU - He, X. AU - Hu, Z. AU - Quackenbush, J. F. AU - Stijleman, I. J. AU - Palazzo, J. AU - Marron, J. S. AU - Nobel, A. B. AU - Mardis, E. AU - Nielsen, T. O. AU - Ellis, M. J. AU - Perou, C. M. AU - Bernard, P. S. PY - 2009 DA - 2009// TI - Supervised risk predictor of breast cancer based on intrinsic subtypes JO - J Clin Oncol VL - 27 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2008.18.1370 DO - 10.1200/JCO.2008.18.1370 ID - Parker2009 ER - TY - JOUR AU - van de Vijver, M. J. AU - He, Y. D. AU - van 't Veer, L. J. AU - Dai, H. AU - Hart, A. A. AU - Voskuil, D. W. AU - Schreiber, G. J. AU - Peterse, J. L. AU - Roberts, C. AU - Marton, M. J. AU - Parrish, M. AU - Atsma, D. AU - Witteveen, A. AU - Glas, A. AU - Delahaye, L. AU - van der Velde, T. AU - Bartelink, H. AU - Rodenhuis, S. AU - Rutgers, E. T. AU - Friend, S. H. AU - Bernards, R. PY - 2002 DA - 2002// TI - A gene-expression signature as a predictor of survival in breast cancer JO - N Engl J Med VL - 347 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa021967 DO - 10.1056/NEJMoa021967 ID - van de Vijver2002 ER - TY - JOUR AU - Wang, Y. AU - Klijn, J. G. AU - Zhang, Y. AU - Sieuwerts, A. M. AU - Look, M. P. AU - Yang, F. AU - Talantov, D. AU - Timmermans, M. AU - Meijer-van Gelder, M. E. AU - Yu, J. AU - Jatkoe, T. AU - Berns, E. M. AU - Atkins, D. AU - Foekens, J. A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Gene-expression profiles to predict distant metastasis of lymph-node-negative primary breast cancer JO - Lancet VL - 365 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(05)70933-8 DO - 10.1016/S0140-6736(05)70933-8 ID - Wang2005 ER - TY - JOUR AU - Sotiriou, C. AU - Wirapati, P. AU - Loi, S. AU - Harris, A. AU - Fox, S. AU - Smeds, J. AU - Nordgren, H. AU - Farmer, P. AU - Praz, V. AU - Haibe-Kains, B. AU - Desmedt, C. AU - Larsimont, D. AU - Cardoso, F. AU - Peterse, H. AU - Nuyten, D. AU - Buyse, M. AU - Van de Vijver, M. J. AU - Bergh, J. AU - Piccart, M. AU - Delorenzi, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Gene expression profiling in breast cancer: understanding the molecular basis of histologic grade to improve prognosis JO - J Natl Cancer Inst VL - 98 UR - https://doi.org/10.1093/jnci/djj052 DO - 10.1093/jnci/djj052 ID - Sotiriou2006 ER - TY - JOUR AU - Loi, S. AU - Haibe-Kains, B. AU - Desmedt, C. AU - Lallemand, F. AU - Tutt, A. M. AU - Gillet, C. AU - Ellis, P. AU - Harris, A. AU - Bergh, J. AU - Foekens, J. A. AU - Klijn, J. G. AU - Larsimont, D. AU - Buyse, M. AU - Bontempi, G. AU - Delorenzi, M. AU - Piccart, M. J. AU - Sotiriou, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Definition of clinically distinct molecular subtypes in estrogen receptor-positive breast carcinomas through genomic grade JO - J Clin Oncol VL - 25 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2006.07.1522 DO - 10.1200/JCO.2006.07.1522 ID - Loi2007 ER - TY - JOUR AU - Loi, S. AU - Haibe-Kains, B. AU - Desmedt, C. AU - Wirapati, P. AU - Lallemand, F. AU - Tutt, A. M. AU - Gillet, C. AU - Ellis, P. AU - Ryder, K. AU - Reid, J. F. AU - Daidone, M. G. AU - Pierotti, M. A. AU - Berns, E. M. AU - Jansen, M. P. AU - Foekens, J. A. AU - Delorenzi, M. AU - Bontempi, G. AU - Piccart, M. J. AU - Sotiriou, C. PY - 2008 DA - 2008// TI - Predicting prognosis using molecular profiling in estrogen receptor-positive breast cancer treated with tamoxifen JO - BMC Genomics VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-9-239 DO - 10.1186/1471-2164-9-239 ID - Loi2008 ER - TY - JOUR AU - Miller, L. D. AU - Smeds, J. AU - George, J. AU - Vega, V. B. AU - Vergara, L. AU - Ploner, A. AU - Pawitan, Y. AU - Hall, P. AU - Klaar, S. AU - Liu, E. T. AU - Bergh, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - An expression signature for p53 status in human breast cancer predicts mutation status, transcriptional effects, and patient survival JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 102 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0506230102 DO - 10.1073/pnas.0506230102 ID - Miller2005 ER - TY - JOUR AU - Ivshina, A. V. AU - George, J. AU - Senko, O. AU - Mow, B. AU - Putti, T. C. AU - Smeds, J. AU - Lindahl, T. AU - Pawitan, Y. AU - Hall, P. AU - Nordgren, H. AU - Wong, J. E. AU - Liu, E. T. AU - Bergh, J. AU - Kuznetsov, V. A. AU - Miller, L. D. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genetic reclassification of histologic grade delineates new clinical subtypes of breast cancer JO - Cancer Res VL - 66 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-05-4414 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-05-4414 ID - Ivshina2006 ER - TY - JOUR AU - Schmidt, M. AU - Böhm, D. AU - von Törne, C. AU - Steiner, E. AU - Puhl, A. AU - Pilch, H. AU - Lehr, H. A. AU - Hengstler, J. G. AU - Kölbl, H. AU - Gehrmann, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - The humoral immune system has a key prognostic impact in node-negative breast cancer JO - Cancer Res VL - 68 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-07-5206 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-07-5206 ID - Schmidt2008 ER - TY - JOUR AU - Sabatier, R. AU - Finetti, P. AU - Cervera, N. AU - Lambaudie, E. AU - Esterni, B. AU - Mamessier, E. AU - Tallet, A. AU - Chabannon, C. AU - Extra, J. M. AU - Jacquemier, J. AU - Viens, P. AU - Birnbaum, D. AU - Bertucci, F. PY - 2011 DA - 2011// TI - A gene expression signature identifies two prognostic subgroups of basal breast cancer JO - Breast Cancer Res Treat VL - 126 UR - https://doi.org/10.1007/s10549-010-0897-9 DO - 10.1007/s10549-010-0897-9 ID - Sabatier2011 ER - TY - JOUR AU - Loi, S. AU - Haibe-Kains, B. AU - Majjaj, S. AU - Lallemand, F. AU - Durbecq, V. AU - Larsimont, D. AU - Gonzalez-Angulo, A. M. AU - Pusztai, L. AU - Symmans, W. F. AU - Bardelli, A. AU - Ellis, P. AU - Tutt, A. N. AU - Gillett, C. E. AU - Hennessy, B. T. AU - Mills, G. B. AU - Phillips, W. A. AU - Piccart, M. J. AU - Speed, T. P. AU - McArthur, G. A. AU - Sotiriou, C. PY - 2010 DA - 2010// TI - PIK3CA mutations associated with gene signature of low mTORC1 signaling and better outcomes in estrogen receptor-positive breast cancer JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 107 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0907011107 DO - 10.1073/pnas.0907011107 ID - Loi2010 ER - TY - JOUR AU - Desmedt, C. AU - Piette, F. AU - Loi, S. AU - Wang, Y. AU - Lallemand, F. AU - Haibe-Kains, B. AU - Viale, G. AU - Delorenzi, M. AU - Zhang, Y. AU - d'Assignies, M. S. AU - Bergh, J. AU - Lidereau, R. AU - Ellis, P. AU - Harris, A. L. AU - Klijn, J. G. AU - Foekens, J. A. AU - Cardoso, F. AU - Piccart, M. J. AU - Buyse, M. AU - Sotiriou, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Strong time dependence of the 76-gene prognostic signature for node-negative breast cancer patients in the TRANSBIG multicenter independent validation series JO - Clin Cancer Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-06-2765 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-06-2765 ID - Desmedt2007 ER - TY - JOUR AU - Pawitan, Y. AU - Bjöhle, J. AU - Amler, L. AU - Borg, A. L. AU - Egyhazi, S. AU - Hall, P. AU - Han, X. AU - Holmberg, L. AU - Huang, F. AU - Klaar, S. AU - Liu, E. T. AU - Miller, L. AU - Nordgren, H. AU - Ploner, A. AU - Sandelin, K. AU - Shaw, P. M. AU - Smeds, J. AU - Skoog, L. AU - Wedrén, S. AU - Bergh, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Gene expression profiling spares early breast cancer patients from adjuvant therapy: derived and validated in two population-based cohorts JO - Breast Cancer Res VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/bcr1325 DO - 10.1186/bcr1325 ID - Pawitan2005 ER - TY - JOUR AU - Hoadley, K. A. AU - Weigman, V. J. AU - Fan, C. AU - Sawyer, L. R. AU - He, X. AU - Troester, M. A. AU - Sartor, C. I. AU - Rieger-House, T. AU - Bernard, P. S. AU - Carey, L. A. AU - Perou, C. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - EGFR associated expression profiles vary with breast tumor subtype JO - BMC Genomics VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-8-258 DO - 10.1186/1471-2164-8-258 ID - Hoadley2007 ER - TY - JOUR AU - Juul, N. AU - Szallasi, Z. AU - Eklund, A. C. AU - Li, Q. AU - Burrell, R. A. AU - Gerlinger, M. AU - Valero, V. AU - Andreopoulou, E. AU - Esteva, F. J. AU - Symmans, W. F. AU - Desmedt, C. AU - Haibe-Kains, B. AU - Sotiriou, C. AU - Pusztai, L. AU - Swanton, C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Assessment of an RNA interference screen-derived mitotic and ceramide pathway metagene as a predictor of response to neoadjuvant paclitaxel for primary triple-negative breast cancer: a retrospective analysis of five clinical trials JO - Lancet Oncol VL - 11 UR - https://doi.org/10.1016/S1470-2045(10)70018-8 DO - 10.1016/S1470-2045(10)70018-8 ID - Juul2010 ER - TY - JOUR AU - Oh, D. S. AU - Troester, M. A. AU - Usary, J. AU - Hu, Z. AU - He, X. AU - Fan, C. AU - Wu, J. AU - Carey, L. A. AU - Perou, C. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Estrogen-regulated genes predict survival in hormone receptor-positive breast cancers JO - J Clin Oncol VL - 24 UR - https://doi.org/10.1200/JCO.2005.03.2755 DO - 10.1200/JCO.2005.03.2755 ID - Oh2006 ER - TY - JOUR AU - Ben-Porath, I. AU - Thomson, M. W. AU - Carey, V. J. AU - Ge, R. AU - Bell, G. W. AU - Regev, A. AU - Weinberg, R. A. PY - 2008 DA - 2008// TI - An embryonic stem cell-like gene expression signature in poorly differentiated aggressive human tumors JO - Nat Genet VL - 40 UR - https://doi.org/10.1038/ng.127 DO - 10.1038/ng.127 ID - Ben-Porath2008 ER - TY - JOUR AU - Liu, R. AU - Wang, X. AU - Chen, G. Y. AU - Dalerba, P. AU - Gurney, A. AU - Hoey, T. AU - Sherlock, G. AU - Lewicki, J. AU - Shedden, K. AU - Clarke, M. F. PY - 2007 DA - 2007// TI - The prognostic role of a gene signature from tumorigenic breast-cancer cells JO - N Engl J Med VL - 356 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa063994 DO - 10.1056/NEJMoa063994 ID - Liu2007 ER - TY - JOUR AU - Finak, G. AU - Bertos, N. AU - Pepin, F. AU - Sadekova, S. AU - Souleimanova, M. AU - Zhao, H. AU - Chen, H. AU - Omeroglu, G. AU - Meterissian, S. AU - Omeroglu, A. AU - Hallett, M. AU - Park, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Stromal gene expression predicts clinical outcome in breast cancer JO - Nat Med VL - 14 UR - https://doi.org/10.1038/nm1764 DO - 10.1038/nm1764 ID - Finak2008 ER - TY - JOUR AU - Shipitsin, M. AU - Campbell, L. L. AU - Argani, P. AU - Weremowicz, S. AU - Bloushtain-Qimron, N. AU - Yao, J. AU - Nikolskaya, T. AU - Serebryiskaya, T. AU - Beroukhim, R. AU - Hu, M. AU - Halushka, M. K. AU - Sukumar, S. AU - Parker, L. M. AU - Anderson, K. S. AU - Harris, L. N. AU - Garber, J. E. AU - Richardson, A. L. AU - Schnitt, S. J. AU - Nikolsky, Y. AU - Gelman, R. S. AU - Polyak, K. PY - 2007 DA - 2007// TI - Molecular definition of breast tumor heterogeneity JO - Cancer Cell VL - 11 UR - https://doi.org/10.1016/j.ccr.2007.01.013 DO - 10.1016/j.ccr.2007.01.013 ID - Shipitsin2007 ER - TY - JOUR AU - Chang, H. Y. AU - Sneddon, J. B. AU - Alizadeh, A. A. AU - Sood, R. AU - West, R. B. AU - Montgomery, K. AU - Chi, J. T. AU - van de Rijn, M. AU - Botstein, D. AU - Brown, P. O. PY - 2004 DA - 2004// TI - Gene expression signature of fibroblast serum response predicts human cancer progression: similarities between tumors and wounds JO - PLoS Biol VL - 2 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0020007 DO - 10.1371/journal.pbio.0020007 ID - Chang2004 ER - TY - JOUR AU - Loberg, R. D. AU - Bradley, D. A. AU - Tomlins, S. A. AU - Chinnaiyan, A. M. AU - Pienta, K. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - The lethal phenotype of cancer: the molecular basis of death due to malignancy JO - CA Cancer J Clin VL - 57 UR - https://doi.org/10.3322/canjclin.57.4.225 DO - 10.3322/canjclin.57.4.225 ID - Loberg2007 ER - TY - JOUR AU - Paik, S. AU - Shak, S. AU - Tang, G. AU - Kim, C. AU - Baker, J. AU - Cronin, M. AU - Baehner, F. L. AU - Walker, M. G. AU - Watson, D. AU - Park, T. AU - Hiller, W. AU - Fisher, E. R. AU - Wickerham, D. L. AU - Bryant, J. AU - Wolmark, N. PY - 2004 DA - 2004// TI - A multigene assay to predict recurrence of tamoxifen-treated, node-negative breast cancer JO - N Engl J Med VL - 351 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa041588 DO - 10.1056/NEJMoa041588 ID - Paik2004 ER - TY - JOUR AU - Bild, A. H. AU - Yao, G. AU - Chang, J. T. AU - Wang, Q. AU - Potti, A. AU - Chasse, D. AU - Joshi, M. B. AU - Harpole, D. AU - Lancaster, J. M. AU - Berchuck, A. AU - Olson, J. A. AU - Marks, J. R. AU - Dressman, H. K. AU - West, M. AU - Nevins, J. R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Oncogenic pathway signatures in human cancers as a guide to targeted therapies JO - Nature VL - 439 UR - https://doi.org/10.1038/nature04296 DO - 10.1038/nature04296 ID - Bild2006 ER - TY - JOUR AU - Hayes, D. F. PY - 2010 DA - 2010// TI - Contribution of biomarkers to personalized medicine JO - Breast Cancer Res VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/bcr2732 DO - 10.1186/bcr2732 ID - Hayes2010 ER - TY - JOUR AU - Albain, K. S. AU - Barlow, W. E. AU - Shak, S. AU - Hortobagyi, G. N. AU - Livingston, R. B. AU - Yeh, I. T. AU - Ravdin, P. AU - Bugarini, R. AU - Baehner, F. L. AU - Davidson, N. E. AU - Sledge, G. W. AU - Winer, E. P. AU - Hudis, C. AU - Ingle, J. N. AU - Perez, E. A. AU - Pritchard, K. I. AU - Shepherd, L. AU - Gralow, J. R. AU - Yoshizawa, C. AU - Allred, D. C. AU - Osborne, C. K. AU - Hayes, D. F. PY - 2010 DA - 2010// TI - Prognostic and predictive value of the 21-gene recurrence score assay in postmenopausal women with node-positive, oestrogen-receptor-positive breast cancer on chemotherapy: a retrospective analysis of a randomised trial JO - Lancet Oncol VL - 11 UR - https://doi.org/10.1016/S1470-2045(09)70314-6 DO - 10.1016/S1470-2045(09)70314-6 ID - Albain2010 ER - TY - JOUR AU - Bonnefoi, H. AU - Underhill, C. AU - Iggo, R. AU - Cameron, D. PY - 2009 DA - 2009// TI - Predictive signatures for chemotherapy sensitivity in breast cancer: are they ready for use in the clinic? JO - Eur J Cancer VL - 45 UR - https://doi.org/10.1016/j.ejca.2009.04.036 DO - 10.1016/j.ejca.2009.04.036 ID - Bonnefoi2009 ER - TY - JOUR AU - Dobbe, E. AU - Gurney, K. AU - Kiekow, S. AU - Lafferty, J. S. AU - Kolesar, J. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Gene-expression assays: new tools to individualize treatment of early-stage breast cancer JO - Am J Health Syst Pharm VL - 65 UR - https://doi.org/10.2146/ajhp060352 DO - 10.2146/ajhp060352 ID - Dobbe2008 ER -