From: Breast cancer prognosis by combinatorial analysis of gene expression data
Patterns | Definition of Patterns | Patterns' coverages (prevalences) on training set | |||||||||||||||||
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 | AB033007 | NM_001661 | NM_001756 | AF148505 | Contig42421_RC | NM_003748 | NM_020974 | AL080059 | AL110129 | Contig15031_RC | Contig65439 | Contig37063_RC | Contig41383_RC | AL049689 | Contig63102_RC | Contig55574_RC | Contig38451_RC |  |  |
 | Attr. 1 | Attr. 2 | Attr. 3 | Attr. 4 | Attr. 5 | Attr. 6 | Attr. 7 | Attr. 8 | Attr. 9 | Attr. 10 | Attr. 11 | Attr. 12 | Attr. 13 | Attr. 14 | Attr. 15 | Attr. 16 | Attr. 17 | Pos Prev | Neg Prev |
P1 |  |  | >-0.42 |  |  |  |  |  |  | ≤0.09 | ≤0.06 |  |  |  |  |  |  | 19 (55.9%) | 0 |
P2 |  |  |  |  |  | ≤0.07 |  |  |  |  | ≤-0.01 |  | ≤0.07 |  |  |  |  | 18 (52.9%) | 0 |
P3 |  |  | >-0.42 |  |  |  |  |  | ≤0.06 |  | ≤0.06 |  |  |  |  |  |  | 18 (52.9%) | 0 |
P4 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ≤-0.01 | ≤0.38 | ≤0.07 |  |  |  |  | 18 (52.9%) | 0 |
P5 |  |  |  |  |  | ≤0.07 | ≤-0.45 |  |  |  | ≤0.06 |  |  |  |  |  |  | 17 (50.9%) | 0 |
P6 | ≤0.33 |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ≤-0.01 |  |  |  | ≤-0.104 |  |  | 16 (47.1%) | 0 |
P7 |  |  |  |  |  | ≤0.07 |  |  |  |  | ≤-0.01 |  |  |  |  | >-0.02 |  | 16 (47.1%) | 0 |
P8 |  |  |  |  |  | ≤0.07 |  | >-0.295 |  | ≤0.033 |  |  |  |  |  |  |  | 16 (47.1%) | 0 |
P9 |  |  | >-0.42 |  |  |  |  |  |  |  | ≤0.06 |  |  | ≤-0.001 |  |  |  | 14 (41.2%) | 0 |
P10 |  | >-0.1 |  |  | ≤-0.11 |  |  |  |  |  | ≤-0.01 |  |  |  |  |  |  | 14 (41.2%) | 0 |
P11 |  | ≤0.03 |  |  |  |  | ≤-0.45 |  |  |  |  |  | ≤0.19 |  |  |  |  | 13 (38.2%) | 0 |
P12 |  |  |  |  |  | ≤0.07 |  | >-0.295 |  |  |  |  |  |  |  | >0.08 |  | 13 (38.2%) | 0 |
P13 |  | ≤0.35 |  |  |  |  |  | >-0.295 |  |  |  |  |  |  |  | >0.08 |  | 13 (38.2%) | 0 |
P14 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ≤0.3 |  | ≤-0.001 |  | >0.08 |  | 13 (38.2%) | 0 |
P15 |  | ≤-0.03 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | >-0.16, ≤0.07 |  |  |  |  | 12 (35.3%) | 0 |
P16 |  |  |  |  |  | ≤0.35 | >-0.96, ≤-0.7 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 10 (29.4%) | 0 |
P17 |  |  | >-0.22 |  |  |  | ≤0.055 | >-0.295 |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 10 (29.4%) | 0 |
P18 | Â | Â | >-0.22 | Â | Â | >-0.48 | Â | >-0.1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 10 (29.4%) | 0 |
P19 |  |  | >-0.22 |  | ≤0.32 |  | ≤0.055 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 10 (29.4%) | 0 |
P20 | Â | Â | >-0.22 | Â | Â | Â | Â | >-0.1 | Â | Â | >-0.27 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 10 (29.4%) | 0 |
N1 | Â | >0.09 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | >-0.005 | Â | Â | 0 | 15 (34.1%) |
N2 |  |  |  |  |  |  |  | ≤-0.295 |  |  |  | >0.06 |  |  |  | ≤-0.02 |  | 0 | 15 (34.1%) |
N3 |  |  |  |  | >-0.11 |  |  |  |  |  |  | ≤0.14 |  |  |  | ≤-0.02 |  | 0 | 15 (34.1%) |
N4 |  |  |  |  |  |  | >0.055 |  |  |  |  |  |  |  |  | ≤-0.02 | ≤1.88 | 0 | 14 (31.8%) |
N5 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | >0.07 | >-0.001, ≤0.17 |  |  |  | 0 | 14 (31.8%) |
N6 |  |  |  |  |  |  | >0.055 |  |  |  |  |  |  |  |  | ≤-0.02 |  | 0 | 14 (31.8%) |
N7 |  |  | ≤-0.22 |  |  |  |  |  |  |  | >0.06 |  |  |  | >-0.005 |  |  | 0 | 14 (31.8%) |
N8 |  |  |  |  |  |  | >0.055 |  |  |  |  |  |  |  |  | ≤-0.02 |  | 0 | 14 (31.8%) |
N9 | Â | >0.09 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | >-0.005 | Â | >-0.083 | 0 | 14 (31.8%) |
N10 |  |  |  |  |  |  |  |  |  | >0.09 |  |  |  |  |  | >-0.12, ≤0.08 |  | 0 | 13 (29.5%) |
N11 |  |  |  | >-0.03 |  |  |  |  |  |  |  | >0.06, ≤0.14 |  |  |  |  |  | 0 | 13 (29.5%) |
N12 |  |  |  | >0.077 |  | ≤0.35 | >0.055 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 0 | 13 (29.5%) |
N13 |  |  |  | >0.077 |  |  |  |  | ≤0.34 |  |  |  |  |  |  | ≤-0.0213 |  | 0 | 13 (29.5%) |
N14 |  |  | ≤-0.22 |  | ≤0.18 |  | >0.055 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 0 | 13 (29.5%) |
N15 | ≤0.21 |  |  | >0.077 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ≤-0.0213 |  | 0 | 12 (27.3%) |
N16 |  |  |  |  |  |  |  | ≤-0.49 |  |  |  |  |  |  |  | >-0.1207 | ≤1.877 | 0 | 12 (27.3%) |
N17 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | >0.06, ≤0.14 |  |  |  | ≤-0.0213 |  | 0 | 12 (27.3%) |
N18 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ≤0.22 |  |  |  | >-0.12, ≤-0.02 |  | 0 | 12 (27.3%) |
N19 |  | ≤0.16 | ≤-0.42 |  |  |  | >-0.197 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 0 | 12 (27.3%) |
N20 | Â | Â | Â | Â | Â | >-0.204 | >-0.197 | Â | Â | Â | >0.13 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 0 | 11 (25.0%) |